Quais as principais dificuldade de uma Iniciação Científica.

Problemas todos temos. Não seria diferente com a IC, assim, acostume-se a trabalhar suas próprias dificuldades e habilidades.
O que gostaria de dizer é que temos habilidades diferentes, ou melhor, habilidades que são mais fortes e outras nem tanto. Estou falando, por exemplo, de organização. A pessoa é muito organizada, mas na hora de fazer as coisas não consegue,  por que não é uma habilidade forte nela. Daí o trabalho para. Outro exemplo, a pessoa é muito boa para escrever, mas não tem habilidade numérica. E para o trabalho de novo.

Muito bem, é isso mesmo, na IC você será cobrado em múltiplas habilidades, como organização, leitura organizada de textos, execução de trabalhos, planejamento, habilidade numérica. Nem todo mundo tem todas as habilidades desenvolvidas, mas na IC você poderá testar seus limites e dificuldades. Com certeza sairá da IC melhor, mesmo que com um sentimento de que poderia ter feito melhor.